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株式会社テクノスルガ・ラボ

微生物に関する試験・分析の受託および関連製品の販売

会社カテゴリー：分析、試験受託サービス

主サービス提供地域：日本

製品・サービス詳細

微生物同定システム「ENKI®」ー相同性検索／分子系統解析ソフトウェア–［専門知識不要で系統樹の作成は可能］［自動実行機能により塩基配列解析の作業を効率化］

サービスカテゴリー：検査

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■　特徴
  • 専門的な知識不要の自動解析機能搭載 (分子系統解析まで実施)
  • 微生物の同定に有効なデータのみで構成
  • 細菌・菌類の2種類のデータベースを用意、毎年更新(新種の登録や移籍の更新に対応)
  • 細菌のデータベースは既知種の80％以上の基準株をカバー (17,138種)
  • ユーザーデータベース機能搭載、「微生物同定データベース」との同時解析が可能(過去のデータと比較解析可能)
  • バイオセーフティレベル出力により、安全性評価が簡単
  • 海外製ソフトウエアと異なり、「ENKI®」の表示はすべて日本語

 

■　概要

DNA塩基配列解析では、国際塩基配列データベース (INSD：DDBJ/ENA/GenBank) の利用がほとんどですが、膨大なDNA塩基配列データが蓄積されているために、微生物の同定に有効なDNA塩基配列データを選択するには多大な手間と時間を要します。また、微生物分類学の専門知識がなければ、微生物の同定が難しいケースが多々あります。

当社では国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ (DNA Data Bank of Japan) センターのご支援により、微生物同定に有効なデータを収集したDNAデータベース「微生物同定データベース」を構築し、当社が開発した簡単に系統解析を可能とする微生物同定ソフトウェア「ENKI®」とあわせて販売しています。

本システムは、解析メニューのボタンが解析手順に沿って並んでいますので、専門知識のないお客様でも簡単に操作可能です。また、解析したい塩基配列を複数選択し、相同性検索から系統解析までを自動で行うことも可能です。

微生物同定データベースは、基準株および学術論文などを参考に精査したDNA塩基配列データで構成されています。バージョンアップは毎年行い、新種提唱された種の基準株や標準由来株のDNA塩基配列データを追加するほか、国際塩基配列データベースに未登録の種の基準株や標準由来株については、必要に応じて当社が独自にDNA塩基配列を解析し、微生物同定データベースに追加しています。

◎ 分かり易い相同性検索結果
学名、株名、国際塩基配列データベースのアクセッション 番号、相同率、バイオセーフティレベルが表示されます。検索結果をPDF形式で保存可能です。

◎ 近縁種の同定が容易
系統樹を描くことで、相同率の比較だけでは理解しにくい近縁種との系統関係を明確にします。系統樹はPDFなどのファイルで保存可能です。

 

■　機能一覧
仕様 備考
複数塩基配列の一括読込 複数の塩基配列データの一括読込が可能です（ドラッグアンドドロップで入力可能）。
ユーザーデータベース お客様自身のデータベース構築が可能です。 検索対象にご選択いただくことより、相同性検索から系統樹作成までの解析が可能です。
複数のデータベースに対する相同性検索 当社が構築した「微生物同定データベース」に対する相同性検索に加え、お客様が構築したユーザーデータベースも併せて指定することで、同時解析が可能です。
マルチプルアライメント／系統樹作成 複数の任意配列を加えての系統解析が可能です。 ユーザーデータベースのデータも解析可能です。 アウトグループを自動選択にすれば、どなたでも系統樹作成が可能です。
自動解析 複数のデータを選択し、相同性検索から系統樹作成まで自動解析が可能です。
インターネットBLAST インターネットに接続できる環境下で、国際塩基配列データベースに対する相同性検索が可能です。

 

■　製品仕様

動作環境：日本語版 Windows® 10 / CPU 2GHz以上 / 64bit /メモリー　2GB以上 / HDD 1GB以上
使用制限：「ENKI®」のご使用は論文発表以外の研究または品質管理目的のみ可能です。
医療や臨床診断、解析受託目的でのご使用はお断りしています。

価格や詳細についてはサービス詳細をご参照ください。

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